У своєму історичному та богословському розвитку протестантизм пройшов становлення наступних течій: лютеранство, цвінгліанство, кальвінізм, анабаптизм, менонітство, англіканство.

Головними гілками протестантизму є – лютеранство, кальвінізм або реформатство, та англіканство. До інших течій протестантизму належать: методизм, баптизм, адвентизм, анабаптизм, конгрегаціоналістська церква, п’ятидесятництво, харизматичний рух, пресвітеріанство, квакеризм, Свідки Єгови тощо.

До протестантизму не належать групи маргінального християнства (свідки Єгови, мормони та ін.)

Відмінність протестантизму від православ’я і католицизму Протестанти поділяють загальнохристиянські уявлення про буття Бога як Творця світу, про його триєдність, про гріховність людини, про безсмертя душі і порятунок, про рай і пекло, відкидаючи католицьке вчення про чистилище, про Божественне одкровення і деякі інші.