Біфідумбактерин при кишкових захворюваннях застосовують внутрішньо, а в акушерсько-гінекологічній практиці та інтравагінально. Вміст флакону розчинити кип'яченою водою кімнатної температури з розрахунку 5 мл (чайна ложка) води на 1 дозу препарату.

Порошок можна змішати з 30-50 мл кип'яченої води кімнатної температури, при цьому утворюється каламутна завись з частинками сорбенту чорного кольору. Отриману водну завись слід випити, не добиваючись повного розчинення. Залежно від тяжкості захворювань Біфідумбактерін форте застосовують у звичайних чи збільшених дозах.

Дорослим та дітям старше 12 років препарат рекомендується приймати по 5 доз 2-3 десь у день. Тривалість курсу лікування визначається тяжкістю клінічної картини, результатами бактеріологічних та інших досліджень, віком хворого та становить 2-4 тижні, а в окремих випадках до 3-х місяців.

Як приймати, курс прийому та дозування дітям старше 6 місяців і доз років по 1 пакету 3-4 рази на день, дітям зі Здо7 років по 1 пакету 3-5 разів на день, дітям старше 7 років по 2 пакети 3-4 рази на день, дорослим по 2 пакети 3-4 десь у день.